این رویداد خاتمه یافته است و اطلاعات موجود در این سایت صرفا جنبه آرشیو دارد
بیست و یکمین کنگره ملی و نهمین کنگره بین‌المللی زیست‌شناسی ایران

21th National & 9th International Congress on Biology

:: کارگاه آموزشی تخصصی آنالیز داده های ترانسکریپتومیکس



کارگاه آموزشی تخصصی آنالیز داده های ترانسکریپتومیکس

ارائه دهنده : ناصر علمی غیاثی
دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک دانشگاه تهران
زمان برگزاری:‌ یکشنبه ۱۹ بهمن ساعت ۸ الی ۱۶:۳۰
اهداف کارگاه:
Seq-RNA یک روش قدرتمند بر پایه‌ی توالی یابی نسل جدید است که محققان را قادر می سازد تا توالی یابی و کمیت رونوشت‌های RNA را در یک مسئله یا آزمایش مشخص نماییم. این تکنیک به ما امکان می دهد تا فعالیت ژنها را در شرایط و یا بافت های مختلف به صورت ظرفیت بالا مورد ارزیابی قرار دهیم. هدف اولیه این کارگاه معرفی این روش و مقایسه آن با روش های دیگر بررسی میزان بیان ژن ها مانند تکنیک میکرواری می باشد. در این کارگاه آنالیز یک مجموعه داده ی Seq-RNA مطابق سرفصل‌ها انجام می گردد.

سرفصل های کارگاه:
  • معرفی پایپلاین (Deseq2/Ballgown+StringTie+HISAT) برای آنالیز داده های ترنسکریپتوم
  • معرفی داده پایگاه های مربوطه به داده های ناشی از Seq-RNA
  • کنترل کیفی خوانش های توالی یابی شده
  • ویرایش و حذف خوانش های نامطلوب
  • نقشه یابی خوانش ها روی ژنوم مرجع
  • اسمبلی خوانش ها
  • شمارش خوانش های مربوط به هر ژن و بررسی تفاوت بیان ژن ها
  • بررسی Gene Ontology
  • مقدمه ای بر شبکه های وزن دار هم بیانی ژن ها
     
نکات مربوط به برگزاری کارگاه:
  • مدت زمان پیشنهادی کارگاه 8 ساعت می باشد.
  • کارگاه به صورت عملی می باشد.
  • کارگاه با استفاده از سرور Galaxy و به صورت آنلاین برگزار می شود.
  • آشنایی اولیه با مفاهیم NGS و داده های آن مفید است.
  • جهت کار عملی با ابزارها، به همراه داشتن لپ تاپ متصل به اینترنت پر سرعت الزامی می باشد.
  • همچنین لطفا قبل از برگزاری کارگاه یک اکانت در این سایت ایجاد نمایید https://usegalaxy.org.




نمایه شده در سیویلیکا

پوستر همایش

کنگره‌ها و کنفرانس‌های علوم زیستی

خبر ویژه: سمپوزیوم کووید-۱۹

سمپوزیم بین‌المللی مجازی تحت عنوان:

"رویکردهای زیست‌شناسی، پزشکی و علوم پایه به کووید-19"

International Virtual Symposium on the Biological, Clinical and Basic Science Approaches to Covid-19


در تاریخ ۲۲-۲۱ شهریور ۱۳۹۹ به میزبانی دانشگاه سمنان و با همکاری خانه زیست‌شناسی ایران با حضور سخنرانان برجسته ملی و بین‌المللی برگزار شده است.

اطلاعات بیشتر در وب‌سایت سمپوزیوم ارائه شده است (در اینجا کلیک کنید).
 

نمایه ISC


کد اختصاصی: ۲۲۰۸۲-۹۹۲۰۰

فایل های مورد نیاز

© کلیه حقوق این وب سایت محفوظ می باشد .
طراحی و پیاده سازی شده توسط : همایش نگار ( ویرایش 10.0.1)